《超级能干的侦探》描述了陈奕先(郭晋安饰)和方志强(刘锡明饰)两个亲密的朋友，他们一起考上了警校，然后被分配到同一个单位服役。强生的善良不是心机，而是有原则，不愿意随波逐流，所以一直被局里的同事反复拒绝。相反，他的好朋友冼聪明，手腕高明，内心深沉，嫉妒心强，名利双收，因此很受同事的器重。有一次，强在一次抓捕行动中受伤，一颗子弹穿过他的心肺，奇迹般地活了下来，但他从此产生了“超能力”。甚至我都不太明白为什么我可以“用眼睛代替手”，“改变形态”或者“电磁效应”。幸运的是，有一个奇怪的人，申杰(谷峰)，他教你控制你的超能力。在一次抓捕歹徒的行动中，强和贤极其惊险，贤被误杀，而强则在危机中不知不觉中用超能力抓捕歹徒，强被提拔。阮文曾经是冼的女朋友。她全心全意地支持冼，但冼多次因私心而忽略了，这让失去了一些东西。从小对薇薇强烈的爱，却时不时的鼓励；薇薇安不受圣贤重视，所以她寻找强势的声音，他们对幼苗的爱逐渐滋生。贤嫉妒强升迁，文再次与贤分手，并坦然爱上贤，于是贤更加愤恨。斯特朗被大副指定为诱饵，歹徒以超能力身陷险境。这时，专家史龙(王龙威饰)现身，用高超的技巧击毙了歹徒。冼亲眼目睹石龙的超能力，告诉强者，强了一会儿，坦白告诉他儿子有超能力；西安被要求去申杰。看穿了冼的居心不良，劝他不要接近石龙，以免走上邪路。但由于生意不如意，冼偶然遇到石龙，石龙引诱他去当学徒。冼名利双收，开始学习石龙的超能力。马凤儿(彭家丽饰)偶然认识了强的母亲关敬红(苏杏璇饰)，两人很投缘。红不仅带着凤二回家，还照顾着凤二。丰二性格犀利活泼，刚开始经常捉弄羌，但在逐渐了解羌的忠厚之后，渐渐喜欢上了羌。冼了解了丰儿的显赫身世，并利用自己的力量结识了丰儿。贤渐渐对丰儿产生了感情，但丰儿对贤没有感情，反而对实力情有独钟。虽然薇薇安多次被丰儿的言行骚扰，但她始终默默忍受。贤者和强者被分成两个不同的团体一起打击犯罪。但是两组领导意见不一致，导致两组人到处抢着上班；一起追查重大刑事案件时，石龙参与其中，龙扬言要杀贤。从此，冼陷入魔途，无法自拔。强智的主人申杰原本是一名大陆公安人员。他来香港是为了逮捕超能力大师史龙，回到大陆受审。在强不屈不挠的追求下，真相逐渐被解开。就在他掌握犯罪证据的时候，被石龙拦截了。当龙正要杀死羌兵时，幸好赶到。虽然他击退了恶龙，但却受了重伤。丰儿也为了救强者牺牲了自己的生命。冼怕自己的事迹败露，不断以超能力杀人，图谋陷害他。虽然强知道的恶行，但他关心自己的友谊，不愿与贤绝交。冼的事迹败露了，他认为冼没有利用价值。如果他想杀贤，他很幸运能坚强的救他。圣贤不知悔改。而是实现更深层次的魔法，除去石龙，不断作恶。忍无可忍，文被故意送到美国，洪被送回农村。没有后顾之忧后，她决定与冼展开一场你死我活的对决。