也许在过去或未来，人类将大规模殖民宇宙。当人口膨胀到5000亿时，分散在宇宙各个角落的人类回到了他们的家园地球，但却引发了一场致命的返乡战争。为了保护地球的圣地，人类颁布了盖亚制裁，其中规定任何人不得触摸这里。然而，曾经是联合舰队船长的哈洛克(由小栗旬配音)背叛了盖亚的制裁，成为了一个被通缉的人，他在叛军的旗帜上高高飘扬着他的阿卡迪亚，从而逃脱了100年。联合舰队司令伊索尔(由森川智之配音)指示他的兄弟阎罗(由三浦春马配音)潜入阿卡迪亚探索尼伯龙根人发明的永动机的秘密。在此期间，霍尔洛克带领他的船员来到地球，而联合舰队在太阳系设置了严密的包围来阻止他。这个遥远的祖国，这个已经消失了很久的真理，震惊了所有人...这部电影是根据松本零士的经典科幻漫画改编的。