“黑书事件”十年后(指神奇女孩奈良的)。19岁的马奇达·纳拉亚、菲特·特·哈洛文和艾申·峰峰都保持着彼此的友谊，加入时空管理局追求自己的梦想，并作为一流的魔法导师积极活跃。在这个过程中，新发现的古代遗产“圣物晶石”和神秘的机械武器“共振显影剂”成为目标。为了快速应对未来将被称为“圣物晶石事件”的事件，考虑到建立一支能够快速应对的独立部队的必要性，八神庵疾风成立了一支专门处理与太古遗产相关任务的特种部队——“机动第六课”。另一方面，时间可以追溯到四年前。当昴·中岛差点死于机场大火时，他被奈叶救了出来。因为期待成为“自己理想的形象”的奈叶，那晚在星空下的常，做出了“成为政府的神奇老师”的决定。四年后，历经波折成功成为新一届政府魔法导师的常与培训学校时代的合作伙伴戴安娜·兰斯特一起挑战魔法导师的升级考试。看着远处两个人的考试的是flurry和fitt，还有nai ye，他们已经决定要成为"第六节机动课"的明星。在这三个人的眼里，“罢工者”的故事是从宣布实验开始的“增援二号”(zwei)开始的。