爱德华·埃利希(由罗米·帕克扮演)和他的弟弟阿尔丰斯(由尼尔·宫城扮演)在埃姆斯·多里斯逗留期间，遇到了梅尔文(由森川智之扮演)，一个可以在两个月内服刑的逃犯。结果是另一方有一种强大的炼金术，并不逊于埃利希兄弟。根据梅尔文留在监狱里的线索，两兄弟去了西部的一个大国家古雷达进行调查。在这里，他们的火车被神秘的黑蝙蝠袭击了，遇到了朱莉亚·克莱顿(由坂本真绫扮演)，一个梅尔文正在寻找的年轻女孩。经过一番混乱之后，他们先后来到了米洛斯，一个贫穷的地下城镇。米洛斯是大国之间裂痕的受害者，她的人民也决定用这颗神圣之星来复兴祖国和民族...这部电影是根据荒川弘的原创漫画改编的。